القصة في الموسم الثاني، تتعاون نيكيتا مع مايكل في محاولة لإسقاط وكالة ديفجن بشتى الطرق وحماية احبائهما بالوقت ذاته، بينما تصعد أماندا عاليا وتتولى إدارة الأمور داخل الوكالة.